インシリコ創薬

インシリコ創薬とは、コンピュータ(IT技術)を活用して行う創薬研究のことです。
ラテン語の「in silico(イン・シリコ)」が「シリコン(半導体の材料)の中で」を意味することに由来しており、実験室での試験管内の実験「in vitro(イン・ビトロ)」や、動物・ヒトなど生体内での実験「in vivo(イン・ビボ)」と対比される言葉です。
具体的には、コンピュータシミュレーションやAI(人工知能)を用いて、以下のようなことを行います。
病気の原因となるタンパク質の立体構造を予測する。
そのタンパク質に結合する可能性のある新薬候補の化合物(リード化合物)を、膨大なデータベースから高速で探索する(バーチャルスクリーニング)。
AIを用いて新しい化合物の構造を設計・生成する。
候補となる化合物が、薬としてどれくらい有効か、あるいは毒性(副作用)がないかをコンピュータ上で予測する。
インシリコ創薬の最大の目的は、従来の実験にかかっていた膨大な時間とコストを大幅に削減し、新薬開発のプロセス全体を高速化・効率化することにあります。

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AI創薬の最前線!OpenMMで加速する分子動力学シミュレーションの基礎と活用法

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医療従事者のための化学情報学入門:Open Babelによる分子構造の前処理術

はじめに:なぜ今、医療現場や創薬に「Open Babel」が必要なのか 現代の創薬研究は、実験室(ウェット)からコンピュータ上(ドライ)へとその舞台を広げています。特にAI(人工知能)を用いた新薬候補の探索において、最も

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AI創薬の精度を左右する「データの質」とは?分子構造標準化ツールMolVSの役割と重要性

1.はじめに:AI創薬における「データの質」という課題 近年、AI(人工知能)を用いた新薬開発、いわゆる「AI創薬」が急速に進展しています。膨大な化学物質の中から、特定の疾患に効果を持つ候補を探し出すプロセスは、まさに「

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創薬シミュレーション成功の鍵となるGROMACS前処理の4つのステップを解説するインフォグラフィック。ステップ1の力場選択、ステップ2の水モデル配置、ステップ3のイオン添加と電荷中和、そしてpdb2gmxからgenionに至るコマンドフローが視覚的に説明されている。

【医師・薬剤師向け】GROMACSで始める分子動力学シミュレーション:創薬の成功率を高める前処理の基本

1.はじめに 医療の現場では、タンパク質の構造異常が病気に直結することが知られています。近年、この複雑なタンパク質の動きをコンピューター上で再現する「分子動力学(MD)シミュレーション」が、治療薬の開発や病態解明において

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GROMACSによる創薬シミュレーションの成功の鍵を握る5つの前処理ステップ(力場の選択、溶媒モデルの設定、イオンの添加と中和、コマンドの実行、エネルギー最小化)を示したインフォグラフィック

GROMACSで進める創薬研究|タンパク質シミュレーション前処理の完全ガイド

1.はじめに:なぜ医療・創薬に「前処理」が重要なのか 現代の創薬プロセスにおいて、コンピューター上でタンパク質の動きを再現する「分子動力学(MD)シミュレーション」は欠かせないツールとなっています。新薬候補化合物が標的タ

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1.はじめに:なぜ今、医療現場で「分子シミュレーション」が重要なのか 現代の医療において、私たちが手にする薬剤の多くは、コンピュータによる緻密な設計を経て誕生しています。その舞台裏で、世界中の研究者が信頼を寄せるツールが

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【初心者向け】GROMACSで始める創薬MDシミュレーション:Windows/Mac環境構築ガイド

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1.はじめに 私たちの生活になくてはならない「お薬」。 頭が痛いとき、熱が出たとき、あるいはもっと重い病気と闘うとき、薬は私たちの命と健康を支えてくれています。 しかし、ひとつの新薬が世に出るまでに、どれくらいの時間とお

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