AI創薬を加速するMDAnalysis入門|Pythonでタンパク質解析を自動化する方法
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インシリコ創薬とは、コンピュータ(IT技術)を活用して行う創薬研究のことです。
ラテン語の「in silico(イン・シリコ)」が「シリコン(半導体の材料)の中で」を意味することに由来しており、実験室での試験管内の実験「in vitro(イン・ビトロ)」や、動物・ヒトなど生体内での実験「in vivo(イン・ビボ)」と対比される言葉です。
具体的には、コンピュータシミュレーションやAI(人工知能)を用いて、以下のようなことを行います。
病気の原因となるタンパク質の立体構造を予測する。
そのタンパク質に結合する可能性のある新薬候補の化合物(リード化合物)を、膨大なデータベースから高速で探索する(バーチャルスクリーニング)。
AIを用いて新しい化合物の構造を設計・生成する。
候補となる化合物が、薬としてどれくらい有効か、あるいは毒性(副作用)がないかをコンピュータ上で予測する。
インシリコ創薬の最大の目的は、従来の実験にかかっていた膨大な時間とコストを大幅に削減し、新薬開発のプロセス全体を高速化・効率化することにあります。
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